Dr Marcin Talar laureatem programu LIDER – NCBR
Poznaliśmy laureatów XII edycji Programu Lider finansowanego przez Narodowe Centrum Badań i Rozwoju. Wśród laureatów grantu znalazł dr Marcina Talar z Zakładu Biochemii. Jego projekt pn. Oparta na konwolucyjnych sieciach neuronowych wspomagana komputerowo diagnostyka endoskopowa wykrywania wczesnych zmian nowotworowych (gruczolaków) w obszarze jelita grubego został wysoko oceniony i zajął 12 miejsce na liście rankingowej (na 56 wniosków). Wartość projektu to blisko 1,5 mln zł.
Celem projektu COMRADE (ang. COMputeR-aided Diagnostics of ADEnoma) jest stworzenie systemu wspomaganej komputerowo diagnostyki lekarskiej, opartego na działaniu konwolucyjnych sieci neuronowych (CNN), który podczas wykonywania zabiegów kolonoskopii będzie pomagał lekarzom w detekcji wczesnych zmian nowotworowych (gruczolaków). Na rynku medycznym istnieje ogromny popyt na narzędzia, na bazie sztucznej inteligencji, które mogłyby ułatwić pracę lekarzom w szpitalach oraz jednostkach klinicznych wykonujących badania i usługi medyczne.
Nowatorskim rozwiązaniem projektu będzie próba stworzenia algorytmu detekcji w taki sposób, aby oprócz wykrywania zmian nowotworowych pozwalał on na tworzenie automatycznego ujednoliconego opisu z przebiegu endoskopii przewodu pokarmowego. Zadanie to będzie realizowane w oparciu o stworzoną nomenklaturę nazewniczą MST (ang. Minimal Standard Terminology) wykorzystywaną w opisach zdjęć endoskopowych oraz segmentację charakterystycznych obszarów jelita grubego, które razem tworzyć będą użyteczną mapę diagnostyczną – mówi dr Talar.
W ramach projektu LIDER przewidziano rozbudowę uczelnianej serwerowni o nowoczesne jednostki obliczeniowe wykorzystujące procesory graficzne, które będą zdolne do szybkiego wykonywania analiz związanych z przetwarzaniem danych pochodzących z obrazów medycznych. Projekt przewiduje również skompletowanie interdyscyplinarnego zespołu badawczego składającego się z lekarzy gastroenterologów z Uniwersytetu Medycznego w Łodzi oraz inżynierów-programistów z Politechniki Łódzkiej. Warto podkreślić, że przyjęta w projekcie koncepcja zyskała aprobatę wiodących dostawców usług związanych z obrazowaniem i analizą danych.
Uniwersytet Medyczny w Łodzi, nadzorujący 3 szpitale kliniczne, jest doskonałym źródłem pozyskiwania dużej liczby zdjęć i sekwencji filmowych dotyczących endoskopii dolnego odcinka przewodu pokarmowego. Ponadto w projekcie przewidziano na wiązanie współpracy z czołowymi jednostkami klinicznymi w kraju, przeprowadzającymi badania kolonoskopowe, w celu stworzenia i prowadzenia ogólnopolskiej, publicznej, zanonimizowanej bazy danych filmów i obrazów kolonoskopowych.
Mamy nadzieję, że wyniki tego interdyscyplinarnego projektu z pogranicza współczesnej medycyny i bioinformatyki, wykorzystującego konwolucyjne sieci neuronowe, będą miały szansę zrewolucjonizować badania kolonoskopowe nie tylko w Polsce, ale także na świecie, znacząco poprawić ich efektywność, a przede wszystkim przyczynić się do dokładniejszej i szybszej diagnostyki pacjentów – dodaje autor projektu
Serdecznie gratulujemy i życzymy dalszych sukcesów!